БМР-3М создан на базе танка Т-90. Спереди машины крепится противоминный трал (ТМТ-С, ДМР или КМТ-7), на котором закреплены тяжёлые стальные колёса. Они катятся перед машиной и при наезде на мину приводят её в действие. Так уничтожаются мины нажимного действия и со штыревыми взрывателями. Машина способна подрывать и магнитные мины – те, что срабатывают на изменение общего магнитного поля и не требуют непосредственного контакта. Для этого над колёсами установлены электромагнитные приставки ЭМТ, испускающие моделированное магнитное излучение. Они подрывают мину заранее, не допуская повреждения машины. Для защиты от снарядов с радиовзрывателями «Вепрь» оснащён генератором радиопомех с широким диапазоном частот. Условно, он «глушит» мины: в этом случае они не уничтожаются, а просто не срабатывают при проезде машины и следующей за ней техники.

Для защиты машины днище БМР-3М усилено и состоит из множества ячеек, заполненных композитным материалом. Сиденья экипажа и десанта оснащены амортизирующими устройствами, которые снижают перегрузки при взрыве в десятки раз. На машине также размещены контейнеры с динамической защитой. Их принцип действия заключается в компенсации взрыва мины ответным взрывом заряда, расположенного на броне. Таким образом, ударная волна рассеивается, не нанося ущерба технике и экипажу.

Конструкторы предусмотрели возможности для защиты машины и в условиях боевых действий. На БМР-3М штатно установлен зенитный пулемёт калибра 12,7 мм. С его помощью командир может вести огонь по наземным, малоскоростным воздушным целям и открыто лежащим на земле минам, оставаясь на своём месте внутри машины. Возимый комплект вооружения включает также ручной гранатомёт, переносной зенитно-ракетный комплекс «Игла» для отражения атак с воздуха, автомат и гранаты. Для маскировки машины во время боя экипаж может активировать систему постановки дымовых завес «Туча».

Машина хорошо приспособлена для работы в экстремальных условиях. Экипаж может автономно существовать до трёх суток в условиях химического, радиоактивного и бактериологического заражения. Для этого в машине есть всё необходимое оборудование: кондиционер, биотуалет, приспособления для подогрева воды и пищи.

Машина оснащена двумя рабочими инструментами. Бульдозерный отвал применяется для расчистки насыпей и пробивания заграждений или снежных заносов. Крылья отвала можно устанавливать в трёх положениях: двухотвальное (крылья соединяются под углом в стреловидный таран), бульдозерное (крылья поставлены в один ряд, перпендикулярный направлению движения) и грейдерное (крылья ставятся в одну линию наискось).

Вторым инструментом является универсальный манипулятор на телескопической полноповоротной стреле. Он может брать и удерживать различные объекты, например, осколки с повышенным радиационным фоном. С помощью манипулятора можно расчищать завалы, валить и убирать деревья, выкорчёвывать пни, проделывать проходы в каменных завалах и невзрывных заграждениях. Манипулятор способен поднимать объекты весом 2 тонны на высоту до 8 м. Кроме того, универсальный манипулятор может использоваться для экскаваторных работ в нескольких режимах: грейфер (разновидность грузозахвата для сыпучих грузов), прямая и обратная лопата, рыхлитель или скребок.

В лесных и каменистых завалах ИМР-3М проделывает проходы со скоростью в среднем 300-400 метров в час, в минных полях – 5-12 км/ч. В сугробе высотой 120 см машина прокладывает путь со скоростью 15 км/ч. При землеройных работах (рытьё котлованов, засыпка рвов) мощность выкапывания составляет до 250 кубов грунта в час, закапывания — до 360 кубов в час.

Машина также может быть оснащена тралом для прохождения минных полей. С его помощью машина выкапывает замаскированные в грунте или снегу мины и отбрасывает их в сторону от колеи. Для траления противоднищевых мин со штыревыми взрывателями и неконтактными магнитными взрывателями используется электромагнитная приставка, аналогичная БМР-3М.

В качестве вооружения на машине установлен 12,7-мм зенитный пулемёт. Его назначение – защита от воздушного нападения, борьба с живой силой и легкобронированными целями.

БРЭМ-1М может выполнять несколько функций, благодаря чему становится незаменимой при проведении боевых действий:

1. Вытаскивать застрявшую технику
2. Буксировать танки и боевые машины пехоты в различных дорожных условиях
3. Откапывать укрытия и расчищать проходы
4. Осуществлять техническую помощь при ремонте и обслуживании танков в полевых условиях
5. Снимать или устанавливать агрегаты и сборочные единицы массой до 20 т

Машина оборудована набором систем и агрегатов, которые определяют её как универсальную технику. На грузовой платформе на крыше корпуса размещаются инструменты и запасные части массой до 1,5 т.

Бульдозер-сошник используется не только для проведения земляных работ и расчистки проходов, но и для закрепления машины при работе тяговой лебёдкой. Машина может буксировать технику весом до 50 т благодаря штангам с внутренней амортизацией и буксирным тросам. Для вытаскивания застрявших танков используется лебёдка с тяговым усилием до 35 т и блоки полиспастов, применение которых увеличивает тяговое усилие до 140 т. Стреловой полноповоротный кран снимает и устанавливает агрегаты весом до 20 т при ремонте танков. В машине также имеется электроаппаратура для резки и сварки.

Чтобы вытянуть технику, БРЭМ-1М создаёт перед собой с помощью сошника-бульдозера земляной вал, необходимый для упора при работе лебёдкой, и зацепляет машину тросом лебёдки.

Экипаж БРЭМ-1М состоит из трёх человек: командира, механика-водителя и сцепщика-такелажника. Для защиты машины установлена зенитно-пулемётная установка 12,7 мм с боекомплектом 840 патронов. С её помощью экипаж может поражать легкобронированные наземные цели и защищаться от нападения с воздуха и живой силы противника.

Многотопливный дизельный двигатель мощностью 1000 л.с. позволяет машине легко выполнять длительные марш броски в составе танковых колон.