После сигнала о воздушной атаке 10 советских истребителей МиГ-3 поднялись в небо. К ним навстречу двигались 85 вражеских бомбардировщиков. Командир эскадрильи 4-го истребительного авиаполка Афанасий Карманов сбил первый самолёт, потом ещё три. В панике самолеты противника налетели друг на друга, совершив три столкновения в воздухе. В этот день над Григориополем, Тирасполем и Кишиневом было сбито около 20 вражеских единиц авиатехники.

Румынская авиация начала совершать налеты над территорией Молдавской ССР ранним утром 22 июня. Первые авиаудары пришлись по Бельцам, Болграду и Кишиневу. Бомбардировке подверглись также Кагул, переправы через Днестр и ряд железнодорожных станций.

С первых дней войны на приграничной территории велись ожесточенные бои. Началась оборона Кишинева, продолжавшаяся
25 дней. Вплоть до 29 июня молдавская граница ни разу не была пересечена противником. К июлю все попытки немецко-румынских войск продвинуться на Кишиневском направлении терпели крах. Бои на территории Молдавии продолжались до 13 августа 1941 года. За это время румынская армия потеряла убитыми 31 638 солдат и офицеров. Однако советской армии пришлось покинуть рубеж. Это было связано с быстрым наступлением немецких войск на западе Советского Союза — в Белоруссии и на Западной Украине. Создавалась опасность окружения всего Южного фронта, если быстро наступающие силы Третьего рейха выйдут к Северному Причерноморью.

На территории Молдавской ССР, оккупированной румынско-германскими войсками, с 1941 по 1944 год действовали приблизительно 3500 партизан, 80 подпольных организаций. В июне 1943 года были созданы Первое молдавское партизанское соединение и Второе молдавское соединение... Более 600 подпольщиков были казнены, более 800 политзаключенных погибли в Тираспольской тюрьме.

Бессарабия и Буковина были отданы Румынии по обоюдному соглашению с Третьим рейхом. Румынское правительство пользовалось регионами как источниками сырья. Все местные торговые и промышленные предприятия передавались в пользование румынским предпринимателям или кооперативам. В Румынию вывозились продовольствие, фураж, промышленные товары, дефицитное сырье. Были разрушены экономика края, системы образования и здравоохранения. Против нерумынского населения региона проводились репрессии. Декретом-законом № 521 от 17 августа 1943 года были узаконены телесные наказания рабочих Бессарабии. За время оккупации пыткам был подвергнут каждый десятый житель Молдавии, или 207 000 человек, из которых 22 700 скончались. На территории Бессарабии действовали 49 лагерей и гетто для евреев и цыган.

Советская Молдавия была освобождена в ходе развернувшейся в августе 1944-го Ясско-Кишинёвской операции. Менее чем за 10 дней, 20–29 августа 1944 года, большая часть Молдавии и Румынии были освобождены, подверглась полному уничтожению значительная группировка гитлеровских войск, а Бухарест заявил о выходе из войны на стороне нацистской Германии и примкнул к Антигитлеровской коалиции. При отступлении из Кишинева гитлеровцы уничтожили около 2 тысяч советских военнопленных, находившихся в лагере, подожгли и взорвали лучшие здания города, разрушили почти все промышленные предприятия, 9388 жилых домов, много школ, административных зданий, телефонную станцию, Телеграф и т. д. Материальный ущерб, нанесенный городу, составил в довоенных ценах 1,5 млрд. рублей. В 1944-1945 годах на фронтах погибло более 40 тысяч уроженцев Молдавии.

В 1941 году с началом военных действий из Молдавии вглубь Союза были эвакуированы 300 тысяч человек. На средства, собранные беженцами, была построена танковая колонна "За Советскую Молдавию". К ноябрю 1942 года было собрано три с половиной миллиона рублей. На эти средства построили 11 танков Т-34-76. Вторая колонна с тем же названием появилась уже после освобождения МССР, в 1944 году. На обе танковые колонны пожертвовано 20 миллионов 463 тысячи рублей и вдобавок к этому почти 65 тысяч пудов хлеба и 411 голов скота.
На средства женщин из Молдовы была построена эскадрилья истребителей Як-7Б.

Около 400 тысяч уроженцев Молдовы воевали в составе Красной Армии. За боевые подвиги 250 тысяч солдат, офицеров и партизан были награждены орденами и медалями.
Уроженец Кишинева комиссар эскадрильи 5-го гвардейского истребительского авиаполка А. М. Соколов в 1941 провел 37 воздушных боев и лично сбил 8 вражеских самолетов. Ему было присвоено звание Героя Советского Союза. Этого высокого звания была удостоена уроженка Кишинева, прославленный снайпер Л. М. Павличенко. Она в боях при обороне Молдавии, Одессы и Севастополя уничтожила 309 фашистов. Уроженец села Кузьмин Ион Солтыс в бою на территории Силезии закрыл своим телом амбразуру. При штурме Кёнигсберга отличился командующий артиллерией 16-го стрелкового корпуса полковник Сергей Полецкий из Бендер. Выросший в селе Новые Криганы (близ Кагула) генерал Никита Лебеденко командовал корпусом, потом стал комендантом Вены. Уроженец села Севериновка Петр Вершигора в 1943-1944 годах командовал знаменитой Первой партизанской дивизией, сформированной Ковпаком...
На данный момент установлено, что 19 уроженцев Молдовы были удостоены звания Героя Советского Союза.

Празднование Дня Победы сейчас как никогда важно для Молдовы. Нередки попытки некоторых политиков принизить роль СССР в победе над фашизмом. Тем не менее, большая часть жителей республики не согласна с такой позицией. Почти в каждой молдавской семье есть родственники и близкие, которые сражались ради Победы, отдавая все свои силы и даже жизнь. На фронте, в подполье, в тылу...
Каждый год 9 мая, 24 августа в Кишиневе и по всей стране проходят масштабные памятные акции в честь Победы в Великой Отечественной войне и Освобождения Молдовы от фашистской оккупации.