В проекте БАКа был заложен необычный способ прокладки дюкеров, который предложил Эрнест Гисин, – монтаж из железобетонных труб диаметром 2,7 метра, которые впоследствии удалось соединить в одну «нитку». Позже была разработана технология монтажа, по которой выпустили инструкцию. Дюкер разрастался, тем самым приближая запуск первого участка канала.
Эрнест Гисин считает, что на сегодня Большой Алматинский канал находится в плачевном состоянии. По его словам, на дюкерах отсутствуют электрифицированные подъемники с верхнего и нижнего бьефов (участок реки или канала между двумя соседними плотинами или шлюзами), предназначенных для очистки дюкера.